Prince z Persie se vrací domů, do Babylonu. Doprovází ho záhadná císařovna času Kaileena, a nevyslovitelné jizvy z Ostrova času.
Ale namísto míru po kterém toužil, nachází své království zpustošené válkou a Kaileena se stáva terčem krutého spiknutí.

Vržen do ulic, štvaný jako uprchlík princ brzy zjistí, že byl písky času nakažen také. Začal se v něm probouzet strašlivý „temný princ“ jehož mysl ho postupně ovládá...
· Vyberte si mezi dvěmi postavami: Oplývejte dovednostmi a zbraněmi dvou mistrů válečníků, s rozdílnými bojovými styly, názory a minulostí.
· Zvolte si vlastní styl eliminace nepřítele: zvládněte rozšířený Free-Form bojový systém a zničte nepřátele svým vlastním způsobem; uškrťte je zdálky s pomocí smrtícího řetězu; nebo je překvapte přesnými smrtícími pohyby. Volba je na vás.
· Bojujte volně uprostřed města: Zmocněte se nepřátel na nebezpečných střechách, unikejte zabijákům ve zmatku ulic a nástrahám pronásledovatelů.
· Ponořte se do dramatického příběhu: Zažijte jedinečnou hloubku vyprávění, kdy se probojujete spletitým příběhem plným adrenalinu, napětí a odhalení.
· Ovládejte čas a překvapte nepřítele: Udeřte na celé armády za pomoci zpomalení nebo převinutí času, nebo je překvapte dalšími novými silami „Písků času“.